Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-1B6SEH8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms