Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTLL13PA6NNM8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms