Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLTPD2A6NH11 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GLTPD2A6NH11 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms