Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms