Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IRGMA1A4Y4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms