Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SMG9Q9H0W8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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