Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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HERC1Q15751 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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HERC1Q15751 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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HERC1Q15751 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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