Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DCX-201ENST00000356220 3019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC087379.2-201ENST00000532242 471 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RN7SL619P-201ENST00000581753 258 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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MKRN4PQ13434 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 ADGRF1-201ENST00000283297 2142 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 NXPE3-207ENST00000616286 1832 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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