Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDH18Q13634 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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