Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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