Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LMO1P25800 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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