Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SRSF5Q13243 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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