Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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BRD3Q15059 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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