Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NPRL3Q12980 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms