Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVV-1B6SEH8 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1821.2 ms