Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms