Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms