Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG4BQ9Y4P1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG4BQ9Y4P1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms