Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms