Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFR3BQ9Y2G0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms