Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HIGD1AQ9Y241 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms