Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNNQ9UQP3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms