Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD4AQ9UPU9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms