Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRPF3Q9ULD4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms