Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP45Q9UL16 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms