Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN3Q9UKS6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms