Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBE1Q9UJT0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms