Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG3Q9UJ98 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STAG3Q9UJ98 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms