Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms