Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGNQ9P2M7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGNQ9P2M7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms