Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms