Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CMTM6Q9NX76 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms