Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXD4L1Q9NU39 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXD4L1Q9NU39 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms