Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms