Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HELLSQ9NRZ9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms