Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPS45Q9NRW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms