Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPHNQ9NQX3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms