Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRC4Q9NPP4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms