Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms