Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD1Q9H446 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms