Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC113Q9H0I3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms