Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZYG11BQ9C0D3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms