Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms