Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXP3Q9BZS1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXP3Q9BZS1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms