Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CRNKL1Q9BZJ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRNKL1Q9BZJ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms