Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NIFKQ9BYG3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms