Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms