Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLVAPQ9BX97 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms