Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KATNB1Q9BVA0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms