Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS4Q9BT78 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms